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Algorithms and Data Structures Capstone

Synthesize your knowledge of algorithms and biology to build your own software for solving a biological challenge.
Algorithms and Data Structures Capstone

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Comienza el 17 sept
4 semanas estimadas
8–10 horas por semana
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Gratis
Cambio opcional de categoría disponible

Sobre este curso

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Building a fully-fledged algorithm to assemble genomes from DNA fragments on a real dataset is an enormous challenge with major demand in the multi-billion dollar biotech industry.

In this capstone project, we will take the training wheels off and let you design your own optimized software program for genome sequencing.

This big data challenge will cover the entire MicroMasters program. After a brief introduction to the steps required to build a genome assembler, we will let you take steps on your own to start working with real data taken from a sequencing machine and see if you can design genome assembly software that can compete with popular software used in hundreds of sequencing labs around the world every day.

De un vistazo

  • Institución: UCSanDiegoX
  • Tema:Informática
  • Nivel:Intermediate
  • Prerrequisitos:

    Basic knowledge of:

    • at least one programming language: loops, arrays, stacks, recursion.
    • mathematics: proof by induction, proof by contradiction.

Lo que aprenderás

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  • Graph algorithms
  • Algorithms for genome assembly
  • Algorithm optimization

Plan de estudios

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This big data challenge will cover the entire program. After a brief introduction to the steps required to build a genome assembler, we will let you take steps on your own to start working with real data taken from a sequencing machine and see if you can design genome assembly software that can compete with popular software used in hundreds of sequencing labs around the world every day.

Testimonios de los estudiantes

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“I write software at a bioscience company, and my duties sometimes have me storing, querying, and organizing bioinformatics data. As a result of your course, I have a much better understanding of the underlying data and analyses. The course has helped me to excel in my job and impress my colleagues.”
-- Previous Student

Acerca de los instructores

¿Quién puede hacer este curso?

Lamentablemente, las personas residentes en uno o más de los siguientes países o regiones no podrán registrarse para este curso: Irán, Cuba y la región de Crimea en Ucrania. Si bien edX consiguió licencias de la Oficina de Control de Activos Extranjeros de los EE. UU. (U.S. Office of Foreign Assets Control, OFAC) para ofrecer nuestros cursos a personas en estos países y regiones, las licencias que hemos recibido no son lo suficientemente amplias como para permitirnos dictar este curso en todas las ubicaciones. edX lamenta profundamente que las sanciones estadounidenses impidan que ofrezcamos todos nuestros cursos a cualquier persona, sin importar dónde viva.

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